For å gjøre de avanserte åndelige servicene han utviklet tilgjengelige for Scientologister i 1968, etablerte L. Ron Hubbard en organisasjon om bord på et fartøy, Flaggskipet Apollo. Mens han fortsatte sin forskning om bord kom Scientologister fra hele verden, for trening og processing tilgjengelig bare på Apollo og overvåket av Mr. Hubbard. Dette ble fulgt av en periode med eksepsjonell økning av Kirkemedlemmer og verdensomspennende ekspansjon.
I 1975 hadde etterspørselen etter service fra «Flag» vokst til slike nivåer at det var behov for større leveringslokaler, og den ideelle eiendommen ble funnet. Ved slutten av det året etablerte L. Ron Hubbard Scientology Kirkens åndelige hovedsete og religiøse fristed i Clearwater, Florida – flaggskip Kirken for religionen. På det tidspunktet dekket den to eiendommer. I dag dekker den et kompleks som består av 56 bygninger innenfor en 32 kilometers radius, som utgjør mer enn et 280 000 kvadratmeter stort areal.
Flag var L. Ron Hubbards visjon for en Kirke hvor levering av servicene ville ha den høyeste kvalitetsstandarden og hvor enhver Scientologist kunne dra nytte av verdens høyest utdannede auditorer. På Flag kan man motta servicer fra de mest grunnleggende til de mest avanserte, så vel som servicer som ikke leveres noe annet sted i verden.
L. Ron Hubbards visjon ble oppfylt i løpet av noen tiår av Styreformannen i Religious Technology Center, Mr. David Miscavige.
Scientology Kirkens Flag-bygning åpnet sine dører søndag den 17. november 2013, da mer enn 10 000 Scientologister samlet seg til innvielsesseremonien ledet av Mr. Miscavige.
Flag-bygningen er unik fordi religionen er unik. Scientology er kulminasjonen av tusenvis av år av menneskets søken etter åndelig frihet kombinert med det 21. århundrets vitenskap og teknologi.
Dette nye åndelige hovedsetet er like vakkert som det er majestetisk. Flag-bygningen dekker et helt kvartal – 35 000 kvadratmeter – og er en majestetisk gjenspeiling av dedikasjonen til religionens medlemmer som bifalte og støttet etableringen under Mr. Miscaviges ledelse. Kirkens elegante katedral gjenspeiler også den enestående veksten av Scientologys forsamling gjennom det siste tiåret, og dens over 40-årige engasjement i det lokale samfunnet.
«Selv om vi har klippet mange bånd de siste årene, og det er mange flere som henger klare og venter på sin dag, så er denne spesiell fordi det er denne som strekker seg fra evighet til uendelighet», sa Mr. Miscavige da han innviet Flag-bygningen. «Og når det faller vil det gå som en bølge gjennom hele realitetens struktur og med dette kunngjøre til det fysiske universet: Din katedral har reist seg og ditt åndelige hovedsete er nå åpent.»
Flag-bygningens Atrium stiger opp gjennom 3 etasjer og dekker hele bygningens lengde – et helt kvartal. Travertinsøylene, veggene, gulvene og trappene i atriets lobby minner om store katedraler fra fortiden. På samme tid er Flag-bygningen, med dens bronse, messing, tre, marmor og glass stilistisk sett tidløs. Det dempede nautiske motivet avspeiler Scientologys maritime arv mens det projiserer en fornemmelse av fremtiden.
Langs hele lengden av atriet står en rekke bronseskulpturer som representerer de grunnleggende begrepene i Dianetics og Scientology. De omfatter de Åtte Dynamic-ene: individets trang, drivkraft eller impuls i retning av overlevelse som seg Selv, Familien, Grupper, Menneskeheten, Livsformer, det Fysiske Universet, det Åndelige Universet og Det Høyeste Vesen eller Uendelighet, samt en visuell fremstilling av en «auditing»-session. Auditing er Scientologys åndelige veiledning som hjelper personen å kvitte seg med åndelige handikap og øker individuelle evner.
Fra førsteetasjen og opp forbi balkongen, står en 10 meter høy frittstående skulptur av en spiraltrapp med menneskeskikkelser på forskjellige nivåer. Den fremstiller den Emosjonelle Tone Skalaen og gjenspeiler progressive nivåer av tilværelsen, fra ufølsom og forkrøplet av åndelige og mentale byrder på bunnen av skalaen, til triumferende kreativ og i brorskap med universet på toppen.
I førsteetasjen finnes et stort informasjonssenter med multimedie-displayer som inkluderer 800 filmer på dusinvis av språk. De presenterer grunnelementene i religionen og oppdaterer Scientologister om humanitære og sosiale programmer sponset av Scientology Kirken rundt om i verden.
Et museum av Kirkens religiøse orden, Sea Organizationen, omfatter Mr. Hubbards kontor og forskningsrom fra Flaggskipet Apollo. Kontoret, som er autentisk ned til minste detalj, inneholder elementer så nøyaktige som de to typene med spansk marmor som matcher det opprinnelige gulvet.
Utstillinger viser mengder av Mr. Hubbards personlige eiendeler, samt modeller av tre skip fra den tidlige Sea Organizationens flåte.
Det store Kapellet, også i førsteetasjen, er rikt på kunstneriske gjenstander. Det sentrale punktet er Scientology Korset med åtte spisser. Det representerer de Åtte Dynamic-ene og er laget av semi-gjennomsiktig honning-onyks. Hvert av Kapellets åtte blyglassvinduer er fire meter høyt og består av 1900 individuelle biter av tysk håndlaget glass og tradisjonell blyinnfatning. Hvert vindu er prydet med en av Faktorene, L. Ron Hubbards sammenfatninger av menneskeånden og dens forhold til det materielle universet.
Flag-bygningen er et arkitektonisk mesterverk som gir Scientologister midlene til åndelig fremgang i omgivelser av passende størrelse for L. Ron Hubbards teknologi.